Jazzliiton keskeisin toimintamuoto on kiertuetoiminta. Kiertueilla kuullaan yhtyeitä suomalaisen jazzin huipulta, ja sen toiminnan myötä Jazzliitto pyrkii parantamaan jazz-tarjontaa sekä muusikoiden työllistymismahdollisuuksia erityisesti pääkaupunkiseudun ulkopuolella. Viime vuosina kiertuetoiminta on sisältänyt kymmenkunta kiertuetta vuosittain, joiden puitteissa kuullaan yhteensä noin 80 konserttia eri puolella Suomea vuosittain.

Helsingissä Jazzliiton näkyvin vuosittainen toiminta liittyy heinäkuussa pidettävään Jazz-Espa -festivaaliin. Kunakin arkipäivänä Espan lavalla kuullaan korkeatasoista suomalaista nykyjazzia, kesällä 2010 yhteensä 20 konsertin verran.

Kiertue- ja konserttitoiminnan lisäksi keskeisiä osa-alueita ovat kansainvälinen yhteistyö sekä erilaiset tiedonvälitys- ja palvelutehtävät.

Kansainvälinen yhteistyö on viime vuosina ollut tiivistä erityisesti Ranskan kanssa. Vapaat äänet -projektit ovat kierrättäneet ranskalaisia ja suomalaisia yhtyeitä yhteiskiertueilla Suomessa ja useat suomalaisyhtyeet ovat vierailleet Ranskassa. Myös pohjoismaiden välinen yhteistyö on ollut aktiivista pohjoismaisen Young Nordic Jazz Comets -yhtyekilpailun myötä. Lisäksi Suomen Jazzliitto on ollut Europe Jazz Networkin jäsen vuodesta 2005 lähtien. Lisäksi Jazzliitto kuuluu pohjoismaiseen NordJazz-verkostoon.

Yksi Jazzliiton perinteisimmistä toimintamuodoista on jo vuodesta 1967 eri puolilla maata aina marraskuussa järjestetty tapahtuma Valtakunnalliset Jazzpäivät. Tapahtuma järjestetään yhteistyössä vuosittain vaihtuvan jäsenyhdistyksen kanssa. Jazzpäivien aikana jaetaan myös Jazzliiton Yrjö-palkinto, suurin tunnustus, jonka suomalainen jazzmuusikko voi saada. Vuoden 2010 Valtakunnalliset Jazzpäivät järjestetään Seinäjoella.

Oman toimintansa lisäksi Jazzliitto toimii yhteistyötahona Töpseli-klubi ja Söndag Jazz -tapahtumissa.